云南农业大学，位于云南省昆明市。云南省属全日制普通高校。学校创办于1938年，时名国立云南大学农学院。1958年独立建成昆明农林学院。1971年与云南农业劳动大学合并成立云南农业大学。

昆明医科大学，位于云南省昆明市。是云南省属重点大学，是省部共建高校。学校办学历史可以追溯到创建于1933年的东陆大学医学专修科。先昆明医科大学是1956年以云南大学医学院独立建制，定名为昆明医学院。2012年升级为为昆明医科大学。

昆明医科大学和云南农业大学都获得了原云南大学的财产，两所学校的建校班底实力差距并不大，而且在省内两所学校都是同类高校中的带头人。

两所学校不同之处在于云南农业大学规模远比昆明医科大学更大一些，这主要是因为云南农业大学合并过同类院校，而且相关跨学科建设更早一些，尤其是建国早期农业占比相当大，所以发展农业建设也是重中之重，因此作为云南农业类第一高校，获得了较快的发展，建立了完整的学科体系。

但是近些年农业热度有所下降，所以云南农业大学规模很大，但质量相对减弱。而同期的昆明医科大学发展相对更快一些，这主要得益于近些年医疗改革，很多病患从地区市进入省城看病，从而使得云南医科大学的病患增加，相对发展速度快了一些。

根据教育部第四轮学科评估结果来看，昆明医科大学有1个B类学科，4个类学科，其中最高评级为B-级的临床医学；云南农业大学有2个B类学科，7个C类学科，其中最高评级为B级学科的植物保护、畜牧学。两相对比，云南农业大学的学科规模更大一些。

综合来看，云南农业大学的实力稍微高于昆明医科大学一点！